La eficiencia de la transferencia de carga es una especificación técnica que describe la eficacia con la que la carga es desplazada de pixel en pixel hasta el registro de lectura. La imagen de un CCD es leída hacia fuera transfiriendo las filas de la carga en un solo registro horizontal, seguidas por transferencia de la carga individual del pixel a lo largo del registro horizontal hacia un solo punto de salida. Mientras que la carga de cada pixel alcanza la marca de salida, es digitalizada y transferida al ordenador para su visualización.

Durante este ciclo, no todos los electrones son transportados eficientemente. Algunos serán atrapados. La eficiencia de transferencia de la carga (CTE) es la especificación del CCD que cuantifica esto. Por ejemplo un CCD con un CTE de 0,99995 y una capacidad del pozo del pixel de 85.000 electrones soltará 4-5 electrones durante la transferencia (0.00005*85,000).